Сферою наукової діяльності фахівців відділення є дослідження організації медичної допомоги дітям шкільного віку та підліткам України та розробка науково обґрунтованих пропозицій щодо актуальних питань удосконалення медичного забезпечення підростаючого покоління.
За результатами багаторічних досліджень розроблено низку рекомендацій щодо його удосконалення. Серед них: методичні рекомендації щодо організаційних стандартів щодо проведення медичних профілактичних оглядів дітей сільської місцевості; регламент робіт сімейного лікаря та технології оцінки його діяльності, що дозволяють підвищити діагностику та виявлення захворювань у дітей, визначити повноту охоплення диспансерним наглядом, покращити якість медичного обслуговування; положення про функціональні обов'язки медичного та педагогічного персоналу дошкільно-шкільних відділень, шкіл-інтернатів, дитячих будинків; заходи щодо медичного забезпечення підготовки юнаків до військової служби; принципи функціонування денних стаціонарів; медичне забезпечення підлітків у дитячих поліклініках, видано довідник «Норми лабораторних досліджень», який може бути використаний у практиці сімейного лікаря, а також лікарів інших спеціальностей.
Співробітники відділення забезпечують проведення науково-практичних конференцій, симпозіумів на базі інституту з актуальних питань фізіології та патології підліткового віку та щомісячних семінарських занять для шкільних лікарів, підліткових терапевтів із залученням головних позаштатних спеціалістів міського управління охорони здоров'я, науковців інститутів та спеціалістів інших закладів.
Науковими працівниками відділення спільно зі спеціалістами МОЗ України проводиться аналіз показників стану здоров'я та медичного забезпечення дітей та підлітків України, видається відповідний збірник, здійснюється надання організаційно-методичної допомоги Управлінням охорони здоров'я обласних держадміністрацій з метою лікувального та профілактичного обслуговування дитячого населення.